和同盟国的ONS-5护航船队发生激烈的遭遇战。先是盟军从格陵兰基地赶来的飞机配合护航舰艇，与德国潜艇交锋。几天后，盟军两个反潜支援大队赶来参战，它们充分发挥了雷达和高频无线电测向仪的作用，当这场战斗结束时，6艘德国潜艇被击沉。三星期后，同盟国飞机和护航舰艇又击沉13艘德国舰艇，而运输船只损失了5艘。接着，在“黑色五月”里，德国潜艇遭到巨大损失，被击沉41艘，邓尼茨被迫放弃北大西洋，准备待技术条件改善后卷土重来。这样，在诺曼底登陆前的12个月里，同盟国的船只能较为顺利地通过北大西洋。

    1943年7月，由于反潜措施成功和美国造船能力的极大提高，同盟国每月的造船量终于超过了每月在世界各地被击沉的数量。1943年年底，大西洋的同盟国取得了年产商船1440万吨的成绩，超过了德国所估计的40％。邓尼茨的吨位战战略终于破产。

    1943年5月下旬，邓尼茨将作战重点转移到亚速尔群岛西南海域，美国护航航空母舰和护航驱逐舰组成的猎潜群正在此跃跃欲试，双方展开角逐。大西洋争夺战进入第六阶段。美国人使用了新型的反潜自导鱼雷，连连击沉德国潜艇，其余德国潜艇被逼得走投无路，只好浮到水面上来还击，于是遭到更大的损失。在不到3月内击沉15艘德国潜艇，自己只损失了3架飞机。从7月28日开始，英国轰炸机对德国潜艇发起了“比斯开湾大屠杀”，在一星期里，击沉9艘德国潜艇，迫使邓尼茨在8月初，下达了停止从比斯开湾基地起航的命令。盟军实际上封锁了德国驻法国的潜艇基地，并在这次比斯开湾的攻击中，共击沉德国潜艇28艘。

    早在1942年，大西洋上就展开了军事技术的较量，英国飞机使用雷达探测潜艇，取得了一些成绩。但德国很快实行反雷达措施，装备了“梅托克斯”雷达接受机，其接受雷达信号距离比对方搜索雷达的目标探测距离远得多，因此英国反潜飞机的优势暂时消失了。1943年初，英国研制出一种波长为10厘米的超高频雷达，这种雷达发射的电波波长是“梅托克斯”探测不到的。为配合这种先进的雷达，同盟国飞机使用一种8000万支光的“利式”探照灯，对德国潜艇进行突然袭击。在大西洋之战的第七阶段里，邓尼茨重新向北大西洋盟国的主要运输线发动进攻，他使用了新研制的“鹪鹩”式音响自导鱼雷，这种鱼雷能循着声源自动撞向舰船的螺旋桨，主要打击护航舰只，撕开对方的警戒幕，以便用常规鱼雷攻击商船。1943年9月，邓尼茨因使用这种新式鱼雷在“黑坑”海域小有收获。但美国很快研制出“福克瑟”噪声发生器，把它拖在舰船后面，吸引“鹪鹩”音响自导鱼雷对其攻击。这场技术较量，最后以盟国的胜利而告终。

    在1943年，德国共损失潜艇237艘，盟军除了技术上的优势外，另一个原因是，葡萄牙在10月同意英国空军使用亚速尔群岛的基地，盟军能利用该基地对北大西洋和中大西洋的运输船队实行夜间空中护航和定期空中巡逻，这对邓尼茨是一个决定性的打击。邓尼茨被迫远离北大西洋的重要海域。1944年，英国前往苏联摩尔曼斯克的运输船队成了德国“狼群”作战的唯一目标，使大西洋争夺战进入第八阶段，也是最后的一次较量。英国派出以护航航空母舰为核心的护航舰艇，还得到反潜支援大队的近距离掩护。经过一年的激烈交锋，英国护航航空母舰在北方海域共击沉13艘德国潜艇，而前往摩尔曼斯克的运输船队仅损失了6艘船只。随后，德国空军对运输船队展开日益猛烈的攻击，结果毫无成效。在这一年的2月至3月里，一些在佛得角群岛加油、准备前往开普敦海域和印度洋的德国潜艇，遭到美国远程护航猎潜群的沉重打击。1944年的印度洋是德国潜艇唯一可以活动的地区，但也和在地中海