1937年7月开始，根据日伪制订的“三年肃正计划”，日伪当局调集5万余兵力，对三江地区进行长达一年半的“大讨伐”。与此同时，日伪仍在伪通化省及间岛省大部、吉林省东部，继续进行“治安肃正”工作。仍有约两万余兵力，分布在伪通化、间岛、吉林等省各地，对抗日军民进行“讨伐”。

    1939年春，敌又在日军和伪军中分别组成挺进队，在伪警察中组成特别工作队，专门对东北抗联第1路军的领导人及所带领的部队进行“讨伐”与捕杀，并通过组织“特别工作队”、特搜班、特务班等打入抗日武装内部进行政治诱降和思想瓦解。

    三江地区的“大讨伐”结束后，日伪当局又把“治安肃正”的重点转到了东南部的伪通化、吉林、间岛三省，于当年10月至1941年3月，进行长达一年半的“三省联合大讨伐”，也称“东南部治安肃正”或“野副大讨伐”。

    在这次大“讨伐”前，日伪进行了一些准备工作。1939年5月，在吉林市组成了以关东军第2独立守备队司令官野副昌德少将为首的“讨伐司令部”。“讨伐司令部”内设参谋部、宪兵部、警察部和伪满军、伪满铁路警护队、伪法院、伪协和会、伪行政联络部等。其中核心机构是参谋部与警察部。

    在参谋部内还编有3个工作队，专门进行政治诱降等工作：第一工作队下设特设游击队和宪兵工作班；第二工作队下设潆江班、桦甸班与辉南班；第三工作队下设安图班、汪清班、延吉班和敦化班。警察部下设伪通化、吉林、间岛等警察大队，内部还设有特务搜查班、指纹班等机构。1939年5月，还在通化新成立了伪军第8军管区，管辖伪通化、安东两省军事，专门用来“讨伐”在东边道一带活动的抗联第1路军。同年9月，又制订了1939年10月至1941年3月的《东边道治安肃正计划》。随后调兵遣将，于1939年10月，开始了“三省联合大讨伐”。

    这次大“讨伐”以东北抗联第1路军为主攻目标，“讨伐”地区有伪间岛省、通化省全部、伪吉林省东部的磐石、桦甸、敦化、蛟河、舒兰等县和伪牡丹江省的宁安县。

    参加这次“讨伐”的日伪军警计有6万余人，其中日军有关东军独立守备队第5、9、21、7、8、4等6个大队，后又增加19、20两个大队，另有20个无线电分队。各大队还分别有由宪兵部配备的日本宪兵多名。总计日军兵力为6400余人。

    参加“讨伐”的伪军有：第2军管区的步兵第2旅、骑兵第2旅、第2教导队，第8军管区的第1、第2、第3混成旅、第8教导队，第6军管区的1个旅，第7军管区的1个旅，第1军管区的步兵第5团，以及通信部队与汽车队等，总计有兵力2.5万余人。

    参加“讨伐”的伪警察队有：通化省警察队（分10个“讨伐”队）、间岛省警察队（分5个讨伐队）、吉林省警察队（分14个讨伐队）、牡丹江省警察队、间岛特设队以及伪通化省全部9县、伪间岛省全部5县，伪吉林省的磐石、桦甸、敦化、蛟河、舒兰等县和伪牡丹江省宁安县的警察队。还有伪通化、间岛、吉林三省及下属各县由警察组织的特别搜查队。此外，还有东南部地区的各伪森林警察队、伪新京警察学校的学兵队、伪营口海上警察队的两架飞机，以及伪锦州、奉天、滨江等省的警察增援队，共计有警察队约3万余人。

    这次“三省联合大讨伐”，日伪仍然采取“治标”与“治本”和“思想工作”相结合的办法进行。在“治标”方面，以日军为主，伪军则受日军部队长直接指挥，同时又利用各省的大批伪警察队参加军事“讨伐”。

    在“讨伐”中，将被“讨伐”的区划分为东、南、西、北、东北5个地区。其中“南地区”包括伪通化省全部，“西地