七七事变后的两个多月里，叶企孙、吴宓、熊大缜等都搬出了清华，叶企孙、熊大缜住进了欧美同学会，吴宓住在其姑妈家，陈寅恪也在城中为其父办理丧事，张奚若、汤用彤、赵元任等诸多教授也都在城中，于是清华大学就在天津设立了临时办事处，以支应师生南下和负责保管清华校产，办事处由叶企孙主持，周培源、熊大缜协助。

    谁知这个时候，叶企孙却得了一场大病。

    从《吴宓日记》里可以得知，搬出清华后的若干天，吴宓、叶企孙几个人经常在一起。到8月中旬，吴宓先是“喉痛”，到了月底，也就是8月27日，吴宓在日记里记述道：“夜2：00即醒，病矣。自是平均约二小时，腹泻一次，发寒。”这是典型的伤寒病症。

    而叶企孙得的正是伤寒。

    吴宓的病到9月初才好，而叶企孙9月初到了天津，不几天就病倒了，这一病，竟病了两个月，严重到曾危及生命的地步。关于叶企孙得病的信息，在《吴宓日记》里均有记载，比如9月12日：“……又悉叶企孙在天津住state el race-course rd（英租界，维多利亚路191a，第3号套房）。在津患病甚重。”到了10月26日，亦有“见叶企孙，病已大愈，惟须休养”的字样。

    清华南迁长沙，其前期工作系叶企孙所完成，他是筹建委员会主任，一应事务均是他张罗定夺。待分校建好，他又负责殿后，任务是将散落在京津地区的清华师生有组织地转送到南方，因为秋季开学日期已过，梅校长三番五次催促，这边叶企孙自然心急如焚，或许是操劳过度，或许是因吴宓传染，等到了天津，待锣鼓家伙备好，正要开张，他却一下子病倒了。叶企孙身体原本不错，也颇懂养生之道，平时不得病，但这样的人，一旦被病魔击倒，往往比常有病的人厉害得多。

    即使得了重病，叶企孙仍念念不忘“转送”工作。吴宓就是他的转送任务之一。

    战争来了，吴宓原本厌世的思想上又增加了一层悲凉。想想一介书生，遭际国难，却没有报效国家的实际本领。他认为自己是个不幸的人，婚姻不幸，爱情不幸，事业不幸。在诸种不幸中最不幸的还是爱情。他对爱情的希冀是那样强烈，为了追求真正的爱情，他抛弃了正常的家庭和婚姻，追来追去，竟是镜中花水中月，剩下的是憔悴的心和枯槁的身。感情的世界行将崩溃，现实世界的一切似乎都不再重要，国家危亡的剧痛也因此而麻木许多。吴宓决计不再南下，他要留下来，看看能不能挽救一场无望的爱情，对那个学生辈的女友“k”发动一下最后的攻势，不成功则自杀。他知道留下来意味着苟且偷生，但他的隐忍是为了爱，如果无爱，他宁可死。一个将死之人，还遑论爱国乎！

    因此，他曾在日记里赋诗一首：

    center">奉酬陈柱尊题《吴宓诗集》，依韵

    center">北都又失好山河，隔岁吟酬涕泪多。

    center">巢覆更愁天欲压，身存未许口能歌。

    center">眼前危境同骑虎，梦里韶华悔掷梭。

    center">志事亭林难学步，梅村才薄耐予何。

    对于老朋友的内心世界，叶企孙一向是有所洞察的。吴宓如此，也并非一日所致，对此，叶企孙是心知肚明的，不然，他也不会把吴宓引为知己。知道吴宓决计留京，终日以拍乒乓球为戏，寄情粉黛之间，颓废失落，发展下去前途堪危，叶企孙决心动员他重新振作起来，继续去长沙执教，在国家危难之时承担起教育者的责任。

    此时叶企孙每日腹泻数次，高烧不退，发如乱草，眼窝深陷，从外貌看已经失形