苏木，象牙，苏油，沉、束、檀、乳诸香，与边民交易，其价尤平，其日用饮食之资于吾民者，如米面猪鸡之数，其价皆倍于常，故边民乐与为市，未尝侵累我边疆，杀戮我人民，劫掠我财物。”

    林希元不是一般的主战派，他坚决反对外敌入侵及官方的绥靖政策。他虽主张用兵，但在海禁与通商政策的选择上，又是积极的通商主义者。他的观点也并非没有局限，甚至为佛郎机人辩解，说他们初来时，也曾担心海盗掠夺自己，为此，他们也曾驱逐横行海上连官府也不能治的强盗林剪。据此，林希元认为，“佛郎机未尝为盗，且为御盗，未尝害吾民，且有利于吾民也”。林希元也坦承，佛郎机人收买华人子女有罪，但在他看来，“罪未至于强盗。边民略诱卖与，尤为可恶，其罪不专在彼”。对此，《提督之死》作者李远江写道：

    与朱纨只管埋头做官不同，林希元十分关注国计民生。他自幼生长在福建海滨，对家乡百姓泛海求生的艰辛深有体会，因而对求食海上的走私贸易有着深切的理解与同情。在他看来，保护和资助当地百姓下海通番，甚至从中获利虽不合天朝法度，但绝不是什么伤天害理的事情。

    面对福建官僚的群起弹劾，朱纨被暂行解职，回原籍听候处理，同时朝廷派两位非闽浙籍官僚兵部给事中杜汝祯和福建巡按御史陈宗夔调查事情真相。调查后得知：所谓葡萄牙人其实是马六甲王国的商人，每年私招沿海无赖之徒，往来海中贩卖外国货物，未尝有僭号流劫之事。之后，被俘虏的葡萄牙人都被认为是马六甲王国的来市者，而非佛郎机行劫者，遂被流放到广西桂林。

    嘉靖皇帝遂下诏要拘捕朱纨到北京询问，朱纨得讯，悲愤交加，上书给嘉靖皇帝说，“纵天子不欲死我，闽浙人必杀我”，“去外夷之盗易，去中国之盗难，去中国之盗易，去中国衣冠之盗难”。

    1549年1月底，他写好《都察院右副都御史秋厓朱公纨圹志》，服药而死，终年57岁。明末著名史学家谈迁的《国榷》说朱纨作为十年中丞，“田不亩辟，家徒壁立”。

    朱纨死得刚烈，死得傲气，他在《圹志》中表明心迹说，一不负天子，二不负君子，“命如之何？丹心青史”。

    朱纨用服药自杀的方式了结自己，对明政府的忠诚天地可鉴，但他没有兼顾到朝廷上下闽浙官僚及其身后以海洋为生的百姓情绪。在宦官集团和文官集团之间，那些既能把握政府（某种程度上是宦官）意图，又能号准民间舆情脉搏的文官，才能博得民间好评，从而在官位上行之既远。明朝的舆论氛围有参政群体扩大化和舆论控制民间化之势，从这种意义上，与其说朱纨是被闽浙人逼死，不如说他是逆了一种趋势而死。

    后来，企图私吞船上货物的抗倭将领卢镗以及朱纨的另一位副手柯乔也被定为死罪，关在按察司狱里，直到另一位苏州人王忬就任浙闽巡抚后，才得赦出，而此时，浙闽巡抚一职已经空了4年。

    王直：在对抗与招抚之间

    卢镗出狱后，与随后亮相的戚继光、俞大猷等一起面对的对手，就是在上述战役中侥幸逃脱的王直。

    王直在双屿战役后，率余部北上定海的烈港，也就是烈表山，距舟山县城30公里。1549年，因官方在遣散剿杀双屿港的福清捕盗船时不支粮饷，导致大半兵船投奔王直麾下，使王直集团成为舟山海域独一无二的大势力，名声大作，并逐步成为继李光头、许栋之后独霸江湖的走私商人集团首领。

    1550年，海盗卢七集团抢劫战船，攻击杭州江头西兴坝堰，劫掠妇女、财货。浙江的海道副使丁湛以“拿贼投献始容互市”为条件，要王直前去剿灭卢七集团，王直遂打垮卢七、沈九等海盗，缴获船只十余艘，消灭千余人。

    1551年，海道副使李文进命令