全国掀起爱国防疫卫生运动。中央人民政府政务院和人民革命军事委员会联合发出指示，要求全国人民大力进行防疫工作，开展广泛的卫生清洁运动，实行灭蝇、灭蚊、灭虱、灭蚤，清秽等，以城市及交通要道为重点。不仅迅速派有关专家和科技人员赴现场检验，及时为反细菌战提供可靠的科学根据，同时在北京、天津、青岛等地建立了科研机构，加强反细菌战的研究。为了加强对全国防疫工作的领导，将原有的中央防疫委员会予以扩充和加强，由周恩来和郭沫若、聂荣臻分别兼任主任、副主任。各大行政区和沿海省、市也成立了防疫委员会。到了3月底，全国已由两万余人组成129个防疫大队，并在国内交通线和国境、海港设立66个检疫站。并加紧研制和发放大批疫苗和消毒杀虫剂。3月上旬将各种疫苗580多万份赶运到朝鲜，以满足志愿军的急需和支援朝鲜军民。4月10日前给东北地区485万余人打了鼠疫预防针。

    中央军委和志愿军总部更果断地采取切实有效的防疫措施，积极展开了反细菌战的战场防疫工作。中央军委于2月21日和25日，两次致电志愿军总部，对反细菌战防疫工作做出具体指示。要求各级领导干部和机关必须把防疫工作当作目前部队和居民工作的首要任务。不管美军的细菌战进行到何种程度，都必须迅速而坚决地进行防疫工作，不容许犹豫和动摇。

    根据中央军委的指示，志愿军于3月1日成立了以邓华为主任，韩先楚、吴之理（志愿军卫生部长）为副主任的总防疫委员会，统一领导全军反细菌战斗争。接着从军到团各级也相继成立了防疫委员会，营、连成立了防疫小组，领导反细菌战防疫工作，实行专业队伍与群众相结合的方法，贯彻以预防为主的方针，由国内派来的40余名专家和数百名防疫人员会同志愿军卫生部防疫人员组成防疫检验队，分别派往前线各兵团和留置志愿军卫生部，担负防疫和检验工作；各军及后勤分部卫生人员组成中型防治队，各师与后勤兵站组成一批小型防治队负责本单位的防治工作。志愿军后勤部还组建7个传染病医院，军以下单位也分别建立了专门的传染病医院、医疗收治组或临时隔离室，以收治、隔离被美国细菌战传染的疫病患者；至4月上旬，志愿军指战员普遍注射了鼠疫疫苗和五联疫苗，注射率达92%以上，对部队驻区附近及铁路、公路沿线两侧各3华里内的朝鲜居民130多万人也注射了疫苗，并支援朝鲜政府大批防疫药材；在部队中广泛深入地进行了反细菌战的思想教育和防疫卫生知识的教育，划分了防疫责任区，建立了疫情侦察勤务，组织对细菌媒介物的扑灭和对沾染区消毒，全军还大力开展了清理驻区卫生的运动，积极捕鼠、灭蝇、灭蚊、灭蚤、灭虱、消灭细菌媒介物，保护水源，改善个人和环境卫生等等。

    采取上述这些有效措施，很快控制了疫情的发展，志愿军的卫生面貌随之改善。大规模反细菌战防疫工作，进行到1952年冬告一段落。我军共发生与细菌战有关的患者384人，治愈者258人。美国实施细菌战不但在政治上、道义上遭到了可耻的失败，而且在军事上也没有达到预期目的。