锁澳门，断绝向葡人区供应米油蔬菜。

    澳门的葡人、华人以及大清驻澳的官员官兵的供给向来依赖内地。封锁引起葡人的极大恐慌，他们铤而走险采取激烈的方式打破封锁。葡萄牙水手截留了一艘给大清驻军运送大米的船，并向其他可能载有大米的船只开火警告，命令他们靠岸检查。姚棻急忙赶回广州，向孙士毅禀报危情。

    孙士毅宣布解除封锁，希望澳葡当局感我天朝仁德，交出钦犯蔡伯多禄。孙士毅派藩司陈用敷向澳葡当局交涉，陈用敷的方式与姚棻如出一辙，自恃天朝官员，饬令澳葡小夷交出钦犯蔡伯多禄，“以示臣服天朝，为我天朝良夷”。澳葡当局不吃这一套，拒不交出蔡伯多禄。

    从八月案发到十月底，各省督抚纷纷上折子向乾隆帝禀报清查邪教的赫赫战果，唯独广东连教案主谋蔡伯多禄都没锁拿归案。乾隆把孙士毅等骂个狗血淋头，孙士毅既惊恐，又惶惑，湖广督抚审讯意大利教士及接引教民，在奏折中特别提到意籍教士持澳门海关的路引进广州，离开十三行持有粤海关监督穆腾额亲自签发的路引。然而，皇上对此事视而不见、一声不吭，死死揪住广东督抚不放。

    躲在桂越边境清剿安南流寇的两广总督舒常，也受到皇上斥责。

    舒常骑马赶到广州时，孙士毅已调动抚标二个营、肇庆协和广州协各一个步兵营、虎门协和顺德协各一个水师营，加上原有的二千余名澳门驻军共计六千官兵，将澳门葡人区围个水泄不通。澳门葡人总计不到四千人，葡兵四百多。孙士毅是个文官，对决胜没有把握。此时，潘振承派信差转呈荷兰及法国商人要求出口湖丝的禀帖。孙士毅亲自接见荷商法商，说他已批准他们要求购买湖丝的禀求，问他们对即将发生的澳门战事的看法，荷法商人一致认为，炮战枪战打不过葡人，如果是肉搏，中国的兵多，胜负就很难说。

    孙士毅焦急万分地恳请舒制军调动督标、军标、提标增援。舒常认为夷务不可绕开理夷官员，上十三行会见潘振承。潘振承介绍情况道：“除英吉利，其他外商在澳门留守人员全部撤离澳门。一旦开火，炮弹没长眼睛，只要伤到一个英吉利人，英吉利人都有理由帮助葡萄牙人。”

    舒常总督两省军事，对英吉利战舰的威力多有耳闻。“英夷为何不走？”舒常不解道。

    潘振承也很疑惑。这个谜只有中国的鸦片贩知道。英国东印度公司与澳葡达成秘密协议，英国的鸦片船只可悬挂葡萄牙国旗驶入澳门，交少许税金便可同中国的走私贩交易。

    “舒制宪，为拿一个钦犯发动一场战争，想必不是皇上所愿看到的。更严峻的是，倘若英吉利卷入，孰胜孰负，老夫就不好妄断。老夫恭请制宪大人三思。”

    舒常责令孙士毅撤军。孙士毅人没抓到，灰溜溜撤军，弄得好没面子。于是他下了一道抚谕给澳葡当局，“谅尔等葡夷惊悚丧胆，夜不成寐，遂萌悔过之意，伏乞恭顺。天朝向来以德驭民，故撤回天朝雄师，以示天朝恩威。”孙士毅仍没忘记敦促葡夷交出天朝钦犯蔡伯多禄，“速交出邪教徒蔡伯多禄伏法，以证尔等确已向化，痛改前非，实为良夷”。

    澳葡总督法利亚也跟孙巡抚开了个玩笑，写了一封没盖公印的私信给孙士毅：“尊敬的孙士毅巡抚，本督不得不向您通报，受中国当局迫害的虔诚天主教徒蔡伯多禄，已于公元一七八四年十月三十日深夜乘坐里斯本号商船离开澳门，前往大葡帝国在印度的属地果阿。估计里斯本号已过马六甲海峡，恭请您向大葡帝国驻果阿总督席尔瓦下达天朝巡抚令，勒令他交出天朝钦犯蔡伯多禄，送往天朝伏法。”

    孙士毅来到潘园，递名剌“拜见”潘启官，向启官表示歉意。启官叫仆役退下，亲手斟茶侍奉孙抚台，启官宽宏大量，令孙士毅放下心来，把澳葡总督法利亚给他的私