快活之余，他对近侍们说：“江祐常不让我在宫内骑马奔跑，这小子今天如果还活着，我怎能这样快活？”又问：“江祐亲戚中还有谁活着？”旁人回答：“江祐弟弟江祥还关在牢里。”萧宝卷在马上挥笔写敕令，赐死唯一活着的表叔。

    始安王萧遥光得知江祐兄弟被杀后，心中惊惧。萧宝卷又下诏召他返回建康议事，更加让他相信小皇帝要杀自己，于是他以讨伐刘暄为名，起兵造反。

    萧遥光是齐明帝的亲侄子。明帝在世时，凡是诛杀齐高帝、齐武帝子孙诸王，都是在萧遥光的参谋建议下行使的，做了不少缺大德的坏事。他率兵连夜攻占建康东城，由于出其不意，开始很顺利，但由于本性怯懦，他并没有乘胜攻入禁宫，丧失了最好的机会。

    天一放亮，台军（首都禁卫军）大集，本来兵锋占优势的萧遥光一日之内兵溃退走，最后跑到床下躲避，被兵士搜出砍头。从起事到被杀，全部加上才不过四日。

    说来也怪，这位萧遥光少年时很正派，齐明帝让当时还是个孩童的萧宝卷常常和萧遥光吃住在一起，感情很深，萧宝卷常昵称萧遥光为“安兄”。萧遥光被杀后，萧宝卷登上旧时和萧遥光一起玩耍的旧宫土山，遥望萧遥光被杀的东府，怆然呼唤“安兄”不已，黯然泪下，估计孩提时代两人的厚笃感情在他心中的印象十分深刻。萧宝卷此种“正常人”的举止，史书上仅此一件（《南史·卷三十一·齐宗室》）。

    平灭萧遥光后，萧宝卷觉得宰杀大臣太容易了。在近侍茹法珍等人的怂勇下，他不到一个月就杀掉本来参与镇压萧遥光叛乱的功臣刘暄、萧坦之和曹虎等大臣。杀刘暄时，萧宝卷还有些犹豫：“刘暄是我亲舅，怎么会谋反呢？”一个侍卫说：“明帝乃武帝同堂（指萧宝卷之父齐明帝与齐武帝是堂兄弟），恩遇如此，犹灭武帝之后，舅舅又怎么可信呢？”于是族灭刘暄。

    六位大臣中，徐孝嗣、沈文季是文人出身不握兵，所以活得稍稍长久一些。有人也劝徐孝嗣废昏立明，他总觉得大动干戈不妥，应该趁小皇帝出城游玩时关闭城门，再召集大臣共议废掉。“书生造反，三年不成”，迟迟也未见他有什么行动。大臣沈文季借口自己老病请假在家，不预朝政，想借此落个善终。他的侄子侍中沈昭略对他说：“叔父您六十岁的年纪，官至仆射，想要免祸是不可能啊！”沈文季笑而不答，很有死猪不怕开水烫的风范。

    499年冬10月，萧宝卷诏令徐孝嗣、沈文季、沈昭略三人入宫议事，一进宫门，茹法珍就把毒酒端上来。沈昭略大怒，骂徐孝嗣：“废昏立明，古今令典；宰相无才，致有今日！”说着话他用盛着毒酒的碗砸向徐孝嗣：“让你死也做个破面鬼！”三人全家被杀。可能徐孝嗣平时应酬多，酒量好，那么毒的毒酒别人饮了一碗就死，他饮了近一斗才被药死。

    此时，六位顾命大臣中只剩下太尉陈显达一个人了。

    陈显达，彭城人，寒人出身，在南朝刘宋时以军功被封为丰城侯。齐高帝即位，拜护军将军、益州刺史。齐武帝即位，进位镇西将军，在益州诛灭山夷和大度村獠人的反叛。齐明帝即位后，进封太尉。

    史载，陈显达谦厚有智谋，自以为寒人出身而位居大官，每次升迁都有愧惧之色。他常常嘱诫自己的十几个儿子：“我本意不及此，汝等勿以富贵凌人！”知道诸子藏有当时的“天下快牛四只（南朝人常以牛拉车比赛炫耀，如同今人赛马。当时的名贵牛是非常昂贵的），陈显达非常不高兴子弟如此暴露富贵。其子陈休尚外出当官与之拜别，陈显达见儿子手里装模作样地拿着根麈尾（魏晋风度的象征物之一），上前夺下当面烧掉，说：“凡奢侈者鲜有不败，麈尾蝇拂是王、谢家物，汝不须捉此自遂。”

    齐明帝残忍好杀，陈显达更是心怀不安，平时所用车乘朽败